Eine Mikrosonde ist eine sehr kleine Sonde, die zum Einsatz kommt, wenn eine reguläre Sonde eines Raumschiffes für die vorgesehene Aufgabe zu groß bzw. ungeeignet ist.
2371 entdeckt die USS Voyager ein kleines Wurmloch, welches sie mit Hilfe einer Mikrosonde genauer untersuchen. Dabei fungiert die Sonde als Überträger, wodurch zum ersten Mal ein temporärer Kontakt zum Alpha-Quadranten etabliert werden kann. (VOY: Das Nadelöhr)